Program perkuliahan diselenggarakan oleh LP3I yang telah bekerjasama dengan berbagai perusahaan dalam penempatan kerja para alumninya. 98% lulusannya telah terserap di dunia kerja.
Berbagai macam mata kuliah yang disusun memberikan bekal bagi mahasantri KEPQ sehingga diharapkan memiliki berbagai kemampuan yang lengkap mulai dari life skill, business skill, hingga kematangan spiritual.
Suasana kondusif bagi calon mahasiswa yang ingin bisa kuliah sambil menghafal Al Quran (bisa hafal minimal 6 Juz). Nuansa religius pesantren yang berlandaskan nilai-nilai kesantunan, kejujuran dan kedisiplinan
KEPQ menerapkan sistem pendidikan formal dan non formal yang berbasis pembangunan karakter.
Pendidikan formal dilakukan di dalam kelas dengan kurikulum lembaga pendidikan dan pelatihan kerja yang bekerjasama dengan Yayasan Nurul Hayat.
Non formal dilakukan dengan penerapan nilai-nilai pesantren dalam keseharian seperti kedisiplinan, kebersihan, sikap melayani dan semangat berdakwah.